2000. július 16-án a Real Madrid pártoló tagjai Florentino Pérezt választották meg klubunk elnökének.
Pérez elnöksége alatt a Real Madrid összesen 66 trófeát nyert: 37-et a labdarúgó szakosztály (7 BEK/Bajnokok Ligája, 7 klubvilágbajnokság, 6 UEFA-szuperkupa, 7 bajnoki cím, 3 Király-kupa, 7 Spanyol Szuperkupa) és 29-et a kosárlabda szakosztály (3 Euroliga, 1 Interkontinentális Kupa, 9 bajnoki cím, 7 Király-kupa, 9 Spanyol Szuperkupa).
Florentino Pérez mélyreható átalakítást hajtott végre a klub minden területén, és mára – a rangos Forbes magazin szerint – a Real Madrid „a világ legértékesebb sportklubjává” vált. Két és fél évtizedes elnöksége alatt a klub látványos modernizáción ment keresztül: felépült a Ciudad Real Madrid edzőközpont, a Santiago Bernabéu stadion pedig átalakítása révén egy élvonalbeli, innovatív létesítménnyé vált, amely a legmagasabb szintű kényelmet, biztonságot és legkorszerűbb technológiát nyújtja.
Florentino Pérez irányítása alatt a Real Madrid történetének egyik legfényesebb sikerkorszaka zajlik: az elmúlt 11 évben 6 BEK/Bajnokok Ligája-trófeát hódított el a csapat – ez is azt mutatja, hogy klubunk 123 éves történelmének milyen rendkívüli időszakát éljük.