Az első mérkőzésén nagyszerű teljesítményt nyújtott a spanyol kiválóság a Cádiz ellen a Ramón de Carranzában. A második félidőben lépett pályára, 2-0-s hátrányban, majd komoly szerepet vállalt abban, hogy csapata végül 2-3 arányban meg tudta nyerni a meccset, egy nagyszerű fordítást produkálva. A támadó mindjárt két góllal kezdte meg a gólgyártást, amivel kiválóan alapozta meg későbbi madridi karrierjét.
Butragueño végül 463 mérkőzésen lépett pályára a csapat színeiben 1984 és 1995 között, mialatt a klub történetének egyik legeredményesebb támadója lett a maga 171 góljával. Emellett kiemelkedő alakja volt a klub egyik legsikeresebb, a „Keselyű ötöse” által fémjelzett időszakának. Trófeagyűjteményében szerepel két UEFA-kupa, 6 bajnoki cím, 2 Király-kupa, 1 ligakupa és 4 Spanyol Szuperkupa.